Школьники классов «Математической вертикали» обучаются по программам и учебно-методическим пособиям, которые разрабатываются специально для этих классов. Пособия опубликованы в библиотеке Московской электронной школы:

• Алгебра. 7 класс 2019/2020

• Алгебра. 8 класс 2019/2020

• Алгебра. 7 класс 2020/2021

• Алгебра. 8 класс 2020/2021

• Алгебра. 9 класс 2020/2021 Коллектив авторов под руководством Комарова Станислава Игоревича

• Геометрия. 7 класс 2019/2020

• Геометрия. 8 класс 2019/2020

• Геометрия. 9 класс 2020/2021 Коллектив авторов под руководством Волчкевича Максима Анатольевича

• Теория вероятностей и статистика. 7 класс 2019/2020

• Теория вероятностей и статистика. 8 класс 2019/2020

• Теория вероятностей и статистика. 9 класс 2020/2021 Коллектив авторов под руководством Высоцкого Ивана Ростиславовича.